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刑部侍郎李志登的奏疏递进内阁时，王锡爵看了一遍，没有批注，直接转呈了御前。皇帝是在之后的一个下午看到的。奏疏写得不长，前面引了大兴县的报告原文，后面附了刑部内部的讨论摘要和三条建议——编判例集、审判分离试点、律例体系化。
皇帝看完之后没有立刻批复，把奏疏放在案角，隔了一天才传旨——次日下午，刑部侍郎、大理寺卿、顺天府尹到文华殿西暖阁议事。太子也来旁听。
文华殿西暖阁的窗子关着，皇帝坐在御案后面，面前摊着李志登的奏疏。下首坐着李志登、大理寺卿赵参鲁、顺天府尹孙廷扬，太子坐在皇帝右手边，面前也放着一份奏疏的抄本。
皇帝没有寒暄：“李志登的奏疏朕看过了。大兴知县查出来的问题，不止在大兴。朕想知道——刑部的意见是改了它，还是补了它？”
李志登拱手道：“皇上，臣以为，改不如补。大明律不是坏了，是不够了。洪武年间的律文，到万历年间还能用，但很多情况律文没有涵盖。条例补了三百多条，但条例本身又太杂，县官拿到手里不知道该用哪条。另外还有一个根本的问题——县官既管审案又管判案，一人说了算。审的人跟判的人是同一个，案子就容易从根上偏。”
皇帝说：“那你们打算怎么补？”
李志登把奏疏里列的三条逐一展开：“第一，编一部判例集，从顺天府各县收集近三年的典型案例，由刑部审定批注，刊印下发，供各县官参考。第二，在顺天府试点‘审、判分离’——县官只审案，判案由府通判复核，不再由县官一人包办。第三，律例体系化，把大明律和问刑条例重新梳理一遍，合并重复、删除过时、补充空缺，形成一部有逻辑的律例全书。”
大理寺卿赵参鲁在旁边补充道：“皇上，臣说句实话。大理寺名义上是复核机关，但这些年收到的案卷，每年大概有近四成需要发回重审，重审的理由几乎都一样：卷宗里找不到判案依据，无法核实判决是否合法。案子在刑部和大理寺之间来回转，拖个一年半载是常事。问题的根子在县里，但烂的是整条线。县官判错了，府里不查，省里也不查，最后到了大理寺就卡住了。”
孙廷扬接话：“皇上，臣在顺天府这些年，见过不少冤案。有些案子县官没有经验，他不知道该怎么判。如果顺天府能先试行审、判分离，府通判复核县官审完的案子，那些错案就能在府一级被拦下来。判错的少一件，往上走的就少一件。”