是医科、针科、按摩科、咒禁科。
医科人数最多，人数加起来有一百余人，差不多占到太医署总人数的二分之一。
以《黄帝內经》《神农本草经》《伤寒杂病论》等经典为基础，注重脉诊、
方剂与药物治疗。
在打下良好的基础之后，可以分为四个就业方向。
体疗科，相当於后世的內科，主攻內科疾病，学制七年，乃是所有学科中最长的。
疮肿科，相当於后世的外科，专治疮疡、外伤等。
少小科，相当於后世的儿科，涵盖小儿疾病与发育保健。
耳目口齿科，相当於五官科，治疗耳、目、口、齿疾病。
可以说，在唐朝，后世的各种科室已经初具雏形。
针科，是医学部排名第二的学科，专攻针灸疗法，以“九针”为主要工具，除了学习医术的基本理论，还需学习《素问》《灵枢经》《明堂脉诀》等一系列典籍。
按摩科排名医学部第三，其所学內容乃是推拿按摩，与五禽戏之类导引术相结合。
其不仅在民间很有群眾基础，而且还可服务於宫廷养生，这使得按摩在隋唐时期无比盛行。
至於咒禁科，则是结合道教符咒、佛教密法与巫术，用於驱邪、避灾及心理抚慰。
虽然迷信，但是在唐朝，確实有一定的心理治疗作用。
这次医学部的改革重点，则是在取消一些学科的基础上，將所有的学科打乱，转而採用后世的学科。
诸如增加基础医学，深度了解疾病发生机制及防治原理。
將原本的医科改为临床医学，简直更为详细的划分，例如外科，內科，妇科，儿科，皮肤科等。
在李承乾的带领下，一行人顺利进入了太医署。
再次过程中，隋朝的孙思邈好奇地打量著四周的环境。
虽然周朝时期也有太医署，但是，周朝的太医署与眼前唐朝的太医署相比，简直是不值一提。
没有费多长的时间，一群人便来到了一间独立的院落。
这是李承乾专门为三位神医准备的研究场所。
来到一间屋前，李承乾敲了敲门。
片刻后，里面传来了一声应答声。
“请进。”
李承乾打开门，进入到屋內。
孙思邈发现，屋子內全是各种各样造型奇特之物，还有著由无比通透的琉璃製成的形形色色的瓶瓶罐罐