取得了联系,从明天开始就会正式开展第一轮筛选。」
徐铭沉声讲述道:
「藉助超级计算机的算力,能省去大量时间。」
在这高达两千个初步设计方案中,其中绝大部分都无法得到想要的蛋白质结构。
如果单靠人力进行实验来试错,那么无论科研经费还是研发周期,都会出现一个恐怖的数倍增长。
但藉助超级计算机和多尺度动态计算模型,则可以快速筛选掉一大部分设计。
然后再通过他对结果洞察,确定最符合学术条件的方案去具体实验,若一切过程顺利的话,那么用不了多长时间就能得到理想蛋白质结构。
成功合成需要的人工酶。
感受着徐铭语气中散发出的自信和胸有成竹,周启深也不由得松了口气。
身上自己给自己的压力,顿时减轻许多。
「看来今晚我是来对了,真让人期待啊!」周启深脸上堆出灿烂笑容。
翌日。
徐铭同全体议题组员,接入超算中心会议室,把初步设计方案序列,输入到模型的快速评估模块。
「序列正在输入。」
「筛选标准为,折叠自由能低于-80千卡每摩尔,金属簇结合能预测值低于-120,底物结合通道在分子模拟中至少保持开放10纳秒。」
「计算开始。」
房间内两地同步播报声音响起,两千个设计被转化为数学模型。
在数字宇宙中经历严酷的演化压力。
有些序列理论上根本无法折叠;有些能折叠,但形成的口袋形状偏离要求;有些虽能结合金属簇,但静电梯度完全错误。
伴随着一个个设计被筛选出局,留下可行性最高的极少部分方案。
整个快速筛选共持续了十二个小时。
众人一直待到了晚上九点,终于拿到筛选结果。
「徐院。」
「根据报告显示,在所有设计中,有13个在100纳秒模拟中保持了结构完整性。」
「金属簇稳定结合,底物通道保持开放。」
路川强忍着心中剧烈的情绪波动,当着全体组员的面向徐铭汇报,关于超级计算机对设计的筛选结果。
在这13个通过筛选的设计中,很有可能就存在,实现酶催化所需的全新蛋白质结构。
关键仅用了半个多月时间,就走到了这一步,放到以前他参与项目时,可以