酶不需要。」
「我们的动态计算模拟显示,二氧化碳分子在进入活性口袋时,其碳氧键的极化程度会随着位置变化。」
「这个静电梯度是为了在特定位置『拉伸』碳氧键,降低其断裂能垒。」
「我明白了。」路川猛地点头回答。
眼中浮现出,从徐铭这里学到新东西的欣喜。
会议进行到这里,相关流程和方案,基本算是初步确定下来。
对此徐铭和周启深也没过多耽搁时间,随即宣布散会后便立刻开始投入实验。
只等化学所根据这些数学约束条件,创造出物理世界中的对应物。
……
之后两周时间里,化学所的蛋白质设计实验室,变成了一个数据与灵感交织的战场。
数台高性能工作站日夜运行,使用蛋白质设计软体进行反向工程,将多尺度动态计算模型的约束条件,转化为胺基酸序列。
「第135号设计,骨架拓扑满足要求,但分子动力学模拟显示,在第58位谷氨酸处会形成一个意外的盐桥,干扰静电梯度。」
「更换它,同时检查β转角是否还能维持。」
类似的对话在实验室每个角落发生,设计过程就像一个多维拼图,改动一个胺基酸,就可能会影响二级结构稳定性和表面亲水性,以及金属配位几何底物通道宽度。
所有变量都相互耦合。
当然在所有人的共同努力下,成果也是斐然,累计设计最终超过了两千个。
6月19日,周三。
本月话题热度最高的高考,已然彻底结束,无数考生终于能享受难得的惬意。
整个人彻底放松下来。
安心等待几天后,考试分数出炉。
不过当视线转到化学所,蛋白质设计实验室内,纵使到了后半夜,依旧能看到很多忙碌的身影。
周启深从家中来到实验室,还没走进去,便刚好在门口碰到了自己学生路川。
那明显的黑眼圈,和打着哈欠的样子,显然这几天没少在实验室熬夜。
「怎么还没有回去休息,这都多晚了?」
见此周启深率先开口关心。
虽说酶催化项目,如今关系到多个方面,有着不得不将其彻底攻克的理由。
但毕竟身体是革命的本钱,必须要有所重视。
听到熟悉的声音,路川下意识擡起视线,看到视野中的身影眼睛顿时放