梦中的碇真嗣似乎听到了有什么人在呼唤着他，但他分辨不出那到底是谁，似乎自己的脑子昏昏沉沉的，根本无法顺利思考。
自己的身体似乎漂浮在暖洋洋的温水之中，像是早晨的被窝，又好像是记忆深处的母亲怀抱，以至于想要一直留在这里。
至于醒来后的世界，又或者是一些莫名其妙的人，现在全都无所谓了，就随他们去吧
随着黑色的十字架棺椁彻底封闭，初号机也闭上了双眼，再次回到了彻底被封印的状态，而只要封印不被打破，不论是其中的初号机还是碇真嗣，都可以一直沉睡到地球毁灭为止。
完成任务的凡躯守护者们收回了光翼，开始逐渐向地球方向降落，而他们降落的目标地点，正是昔日的美洲大陆。
委员会控制的北美一号支部，正在和美国政府控制的北美二号支部进行着最终的对抗，而凡躯守护者就是为此被召回的。